MARCADORES MOLECULARES PARA CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA E GENÔMICA EM ESPÉCIES DE Psidium
Nome: LUARA LOPES SOUSA
Tipo: Dissertação de mestrado acadêmico
Data de publicação: 28/02/2019
Orientador:
Nome |
Papel |
|---|---|
| ADÉSIO FERREIRA | Co-orientador |
| MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA | Orientador |
Banca:
| Nome |
Papel |
|---|---|
| ADÉSIO FERREIRA | Coorientador |
| AMÉLIA CARLOS TULER | Examinador Externo |
| GREICIANE GABURRO PANETO | Examinador Externo |
| MARCIA FLORES DA SILVA FERREIRA | Orientador |
Resumo: Marcador molecular pode ser um caracter visível ou um fenótipo molecular proveniente de
um segmento específico de DNA, que pode ser expresso ou não. Os marcadores de DNA
microssatélites e SNPs são os mais utilizados atualmente, possibilitam diferentes estudos de
espécies vegetais por apresentarem vantagens como polimorfismo, abundância e robustez.
Muitos desses são conservados, podendo ser estudados em espécies afins àquela para o qual
foi desenvolvido. Esses marcadores são importantes no estudo de grupos pouco conhecidos,
como as espécies do gênero Psidium L., as quais possuem importante papel ecológico e são de
grande interesse econômico, entre as quais está a goiabeira (Psidium guajava). Neste trabalho
objetivou-se desenvolver dois painéis de marcadores moleculares, um de SSR e outro de
SNPs, que sejam polimórficos e estejam presentes em regiões conservadas para espécies de
Psidium. Um painel multiplex, para caracterização interespecífica de 26 espécies do gênero,
foi montado por marcadores microssatélites conservados e polimórficos. Os 15 SSR
selecionados foram marcados com fluoróforos, testados em combinações e genotipados
através de eletroforese capilar, enquanto os marcadores SNPs foram sequenciados por meio
do método DArTseq. Para ambos marcadores foram feitas análises descritivas e
agrupamentos, sendo um heatmap e agrupamento para os microssatélites e uma análise de
coordenadas principais (PCoA) para os SNPs. Os marcadores microssatélites e SNPs
selecionados apresentaram índices de diversidade úteis para estudos em P. guajava. Foi
estabelecido um painel multiplex contendo sete marcadores microssatélites para genotipagem
eficiente em genótipos de goiabeiras. Um total de 5.951 SNPs polimórficos em sequências
conservadas foram selecionados para compor o painel em chip para espécies de Psidium. No
geral, as duas metodologias foram eficientes e ambos os marcadores informativos e úteis para
estudos intra e interespecíficos.
